Решение о создании ГАС «Выборы» принято Указом Президента РФ от 23 августа 1994 года № 1723 «О разработке и создании Государственной автоматизированной системы Российской Федерации „Выборы“». Этому предшествовало годичное утверждение Концепции создания ЦИК России от 12 июля 1994 года, а еще раньше — написанная по результатам исследований электоральных технологий "Концептуальная записка по программе разработки и создания Государственной автоматизированной системы Российской федерации «Выборы», сформированная работниками НИИ «Восход» середине 1994 года.

Юрий Сергеевич Ломов, главный конструктор, обеспечил впервые в СССР создание Государственной автоматизированной системы «Выборы» в ФГУП НИИ «Восход».

Генеральный заказчик системы — Центральная избирательная комиссия Российской Федерации. Представитель заказчика — Федеральный центр информатизации при ЦИК России.

В работе по модернизации ГАС «Выборы» во главе с НИИ «Восход» были задействованы компании КРОК инкорпорейтед, Роснет, Информзащита, «Инсофт», «АНД Проджект» .

Вторая очередь ГАС «Выборы» разработана ФГУП НИИ «Восход» по заказу ЦИК России и ФЦИ при ЦИК России в 2003 году. В 2004 году ГАС «Выборы» повторно прошла Государственные приемочные испытания.